Aktivno sodeluje v različnih slovenskih in mednarodnih organizacijah – je  in SMUL ter član , kjer zagovarja med raziskovalci doma in v tujini. Njegova skupina razvija napredne eksperimentalne in računalniške metode za preučevanje RNA, med drugim tudi orodje flow.bio, ki spodbuja odprto znanost in ponovljivost raziskav. 

Zanimanje za biologijo mu je privzgojil dedek, ki mu je kot otroku namenil del vrta, kar je privedlo do njegovega opazovanje narave. Pri izbiri med študijem biologije in arhitekture je odločil kar met kovanca. Pomemben mejnik na njegovi poti je bila štipendija, ki jo je dobil po naključju že v prvem letniku študija, kar mu je omogočilo prvo izkušnjo v tujini. Pomembno vlogo pri tem je imela prof. Ana Plemenitaš, ki ga je pripravila na raziskovalno delo in odhod na gostovanje v tujino.

Dr. Ule poudarja, da mu je tujina prinesla predvsem kulturno in osebnostno izkušnjo, saj je tam spoznal različne načine dela in mišljenja. Njegova karierna pot se je razvijala postopoma, brez večjih preskokov, ob močni podpori sodelavcev, raziskovalcev in profesorjev doma ter po svetu.

Dr. Jernej Ule o svoji karierni poti: od Ljubljane do New Yorka in Cambridgea